Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RubcnlQ3TD16 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RubcnlQ3TD16 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RubcnlQ3TD16 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RubcnlQ3TD16 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RubcnlQ3TD16 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RubcnlQ3TD16 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RubcnlQ3TD16 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RubcnlQ3TD16 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RubcnlQ3TD16 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RubcnlQ3TD16 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RubcnlQ3TD16 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RubcnlQ3TD16 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RubcnlQ3TD16 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RubcnlQ3TD16 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RubcnlQ3TD16 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RubcnlQ3TD16 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RubcnlQ3TD16 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RubcnlQ3TD16 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RubcnlQ3TD16 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RubcnlQ3TD16 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RubcnlQ3TD16 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RubcnlQ3TD16 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RubcnlQ3TD16 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RubcnlQ3TD16 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RubcnlQ3TD16 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RubcnlQ3TD16 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RubcnlQ3TD16 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RubcnlQ3TD16 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RubcnlQ3TD16 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RubcnlQ3TD16 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RubcnlQ3TD16 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RubcnlQ3TD16 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RubcnlQ3TD16 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RubcnlQ3TD16 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RubcnlQ3TD16 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RubcnlQ3TD16 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RubcnlQ3TD16 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RubcnlQ3TD16 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RubcnlQ3TD16 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RubcnlQ3TD16 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RubcnlQ3TD16 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RubcnlQ3TD16 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RubcnlQ3TD16 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RubcnlQ3TD16 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RubcnlQ3TD16 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RubcnlQ3TD16 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RubcnlQ3TD16 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RubcnlQ3TD16 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RubcnlQ3TD16 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RubcnlQ3TD16 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RubcnlQ3TD16 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RubcnlQ3TD16 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RubcnlQ3TD16 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RubcnlQ3TD16 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RubcnlQ3TD16 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RubcnlQ3TD16 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RubcnlQ3TD16 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RubcnlQ3TD16 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RubcnlQ3TD16 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RubcnlQ3TD16 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RubcnlQ3TD16 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RubcnlQ3TD16 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RubcnlQ3TD16 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RubcnlQ3TD16 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RubcnlQ3TD16 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RubcnlQ3TD16 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RubcnlQ3TD16 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RubcnlQ3TD16 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RubcnlQ3TD16 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RubcnlQ3TD16 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RubcnlQ3TD16 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RubcnlQ3TD16 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RubcnlQ3TD16 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RubcnlQ3TD16 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms