Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Cnnm3Q32NY4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Cnnm3Q32NY4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Cnnm3Q32NY4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Cnnm3Q32NY4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Cnnm3Q32NY4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Cnnm3Q32NY4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Cnnm3Q32NY4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Cnnm3Q32NY4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26,87■■□□□ 1,89
Cnnm3Q32NY4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26,87■■□□□ 1,89
Cnnm3Q32NY4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Cnnm3Q32NY4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Cnnm3Q32NY4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Cnnm3Q32NY4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Cnnm3Q32NY4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Cnnm3Q32NY4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Cnnm3Q32NY4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Cnnm3Q32NY4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Cnnm3Q32NY4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Cnnm3Q32NY4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Cnnm3Q32NY4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Cnnm3Q32NY4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Cnnm3Q32NY4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Cnnm3Q32NY4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Cnnm3Q32NY4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Cnnm3Q32NY4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Cnnm3Q32NY4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Cnnm3Q32NY4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Cnnm3Q32NY4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Cnnm3Q32NY4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Cnnm3Q32NY4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Cnnm3Q32NY4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Cnnm3Q32NY4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Cnnm3Q32NY4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Cnnm3Q32NY4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Cnnm3Q32NY4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Cnnm3Q32NY4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Cnnm3Q32NY4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Cnnm3Q32NY4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Cnnm3Q32NY4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26,76■■□□□ 1,87
Cnnm3Q32NY4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Cnnm3Q32NY4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Cnnm3Q32NY4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Cnnm3Q32NY4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Cnnm3Q32NY4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Cnnm3Q32NY4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Cnnm3Q32NY4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26,72■■□□□ 1,87
Cnnm3Q32NY4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Cnnm3Q32NY4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Cnnm3Q32NY4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Cnnm3Q32NY4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Cnnm3Q32NY4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Cnnm3Q32NY4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Cnnm3Q32NY4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Cnnm3Q32NY4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Cnnm3Q32NY4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Cnnm3Q32NY4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Cnnm3Q32NY4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Cnnm3Q32NY4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Cnnm3Q32NY4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Cnnm3Q32NY4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Cnnm3Q32NY4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Cnnm3Q32NY4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Cnnm3Q32NY4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Cnnm3Q32NY4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Cnnm3Q32NY4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Cnnm3Q32NY4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Cnnm3Q32NY4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Cnnm3Q32NY4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Cnnm3Q32NY4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Cnnm3Q32NY4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Cnnm3Q32NY4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Cnnm3Q32NY4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Cnnm3Q32NY4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Cnnm3Q32NY4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Cnnm3Q32NY4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Cnnm3Q32NY4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Cnnm3Q32NY4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Cnnm3Q32NY4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Cnnm3Q32NY4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Cnnm3Q32NY4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Cnnm3Q32NY4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Cnnm3Q32NY4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Cnnm3Q32NY4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Cnnm3Q32NY4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Cnnm3Q32NY4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Cnnm3Q32NY4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Cnnm3Q32NY4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Cnnm3Q32NY4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26,55■■□□□ 1,84
Cnnm3Q32NY4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Cnnm3Q32NY4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Cnnm3Q32NY4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Cnnm3Q32NY4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Cnnm3Q32NY4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Cnnm3Q32NY4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Cnnm3Q32NY4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Cnnm3Q32NY4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Cnnm3Q32NY4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Cnnm3Q32NY4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Cnnm3Q32NY4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,8 ms