Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim71Q1PSW8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim71Q1PSW8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim71Q1PSW8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim71Q1PSW8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim71Q1PSW8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim71Q1PSW8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim71Q1PSW8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim71Q1PSW8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim71Q1PSW8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim71Q1PSW8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim71Q1PSW8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim71Q1PSW8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim71Q1PSW8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim71Q1PSW8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim71Q1PSW8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim71Q1PSW8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim71Q1PSW8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim71Q1PSW8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
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