Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxc4Q08624 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxc4Q08624 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc4Q08624 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc4Q08624 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc4Q08624 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc4Q08624 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc4Q08624 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc4Q08624 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc4Q08624 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc4Q08624 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc4Q08624 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc4Q08624 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc4Q08624 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc4Q08624 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc4Q08624 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc4Q08624 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc4Q08624 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc4Q08624 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc4Q08624 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc4Q08624 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc4Q08624 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc4Q08624 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc4Q08624 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc4Q08624 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc4Q08624 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc4Q08624 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc4Q08624 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc4Q08624 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc4Q08624 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc4Q08624 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc4Q08624 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc4Q08624 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc4Q08624 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc4Q08624 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc4Q08624 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc4Q08624 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc4Q08624 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc4Q08624 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc4Q08624 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc4Q08624 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc4Q08624 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc4Q08624 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc4Q08624 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc4Q08624 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc4Q08624 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc4Q08624 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc4Q08624 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc4Q08624 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc4Q08624 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc4Q08624 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc4Q08624 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc4Q08624 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc4Q08624 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc4Q08624 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc4Q08624 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc4Q08624 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms