Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AmbpQ07456 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AmbpQ07456 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmbpQ07456 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmbpQ07456 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmbpQ07456 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmbpQ07456 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmbpQ07456 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmbpQ07456 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AmbpQ07456 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AmbpQ07456 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AmbpQ07456 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AmbpQ07456 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AmbpQ07456 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AmbpQ07456 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AmbpQ07456 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AmbpQ07456 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AmbpQ07456 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AmbpQ07456 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AmbpQ07456 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AmbpQ07456 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms