Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp39Q02525 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Zfp39Q02525 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Zfp39Q02525 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zfp39Q02525 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zfp39Q02525 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zfp39Q02525 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zfp39Q02525 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zfp39Q02525 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zfp39Q02525 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zfp39Q02525 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zfp39Q02525 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zfp39Q02525 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Zfp39Q02525 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zfp39Q02525 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zfp39Q02525 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zfp39Q02525 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zfp39Q02525 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zfp39Q02525 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp39Q02525 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp39Q02525 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp39Q02525 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp39Q02525 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp39Q02525 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp39Q02525 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp39Q02525 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zfp39Q02525 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zfp39Q02525 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zfp39Q02525 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zfp39Q02525 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zfp39Q02525 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zfp39Q02525 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zfp39Q02525 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zfp39Q02525 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zfp39Q02525 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zfp39Q02525 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zfp39Q02525 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zfp39Q02525 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zfp39Q02525 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zfp39Q02525 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zfp39Q02525 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zfp39Q02525 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms