Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd1Q01822 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd1Q01822 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd1Q01822 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd1Q01822 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd1Q01822 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd1Q01822 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd1Q01822 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd1Q01822 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd1Q01822 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd1Q01822 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd1Q01822 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd1Q01822 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd1Q01822 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd1Q01822 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd1Q01822 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd1Q01822 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd1Q01822 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd1Q01822 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd1Q01822 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd1Q01822 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd1Q01822 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd1Q01822 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd1Q01822 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd1Q01822 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd1Q01822 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd1Q01822 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd1Q01822 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd1Q01822 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd1Q01822 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd1Q01822 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd1Q01822 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd1Q01822 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd1Q01822 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd1Q01822 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms