Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gbp1Q01514 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gbp1Q01514 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gbp1Q01514 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gbp1Q01514 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gbp1Q01514 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gbp1Q01514 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gbp1Q01514 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gbp1Q01514 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gbp1Q01514 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gbp1Q01514 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gbp1Q01514 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gbp1Q01514 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gbp1Q01514 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gbp1Q01514 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gbp1Q01514 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gbp1Q01514 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gbp1Q01514 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gbp1Q01514 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gbp1Q01514 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gbp1Q01514 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gbp1Q01514 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gbp1Q01514 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gbp1Q01514 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gbp1Q01514 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gbp1Q01514 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gbp1Q01514 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gbp1Q01514 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gbp1Q01514 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gbp1Q01514 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gbp1Q01514 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gbp1Q01514 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gbp1Q01514 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gbp1Q01514 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gbp1Q01514 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gbp1Q01514 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gbp1Q01514 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gbp1Q01514 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gbp1Q01514 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gbp1Q01514 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gbp1Q01514 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gbp1Q01514 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gbp1Q01514 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gbp1Q01514 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gbp1Q01514 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gbp1Q01514 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gbp1Q01514 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gbp1Q01514 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp1Q01514 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp1Q01514 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp1Q01514 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp1Q01514 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gbp1Q01514 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gbp1Q01514 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gbp1Q01514 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gbp1Q01514 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gbp1Q01514 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gbp1Q01514 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gbp1Q01514 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gbp1Q01514 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gbp1Q01514 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gbp1Q01514 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gbp1Q01514 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gbp1Q01514 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gbp1Q01514 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp1Q01514 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp1Q01514 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp1Q01514 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp1Q01514 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp1Q01514 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp1Q01514 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp1Q01514 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp1Q01514 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbp1Q01514 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbp1Q01514 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbp1Q01514 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms