Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grin2cQ01098 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grin2cQ01098 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Grin2cQ01098 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Grin2cQ01098 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grin2cQ01098 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Grin2cQ01098 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2cQ01098 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2cQ01098 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2cQ01098 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grin2cQ01098 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grin2cQ01098 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grin2cQ01098 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grin2cQ01098 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grin2cQ01098 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Grin2cQ01098 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grin2cQ01098 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grin2cQ01098 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grin2cQ01098 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grin2cQ01098 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grin2cQ01098 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grin2cQ01098 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grin2cQ01098 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Grin2cQ01098 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Grin2cQ01098 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Grin2cQ01098 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Grin2cQ01098 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Grin2cQ01098 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Grin2cQ01098 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grin2cQ01098 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms