Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cited1P97769 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cited1P97769 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cited1P97769 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cited1P97769 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cited1P97769 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cited1P97769 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cited1P97769 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms