Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Npas1P97459 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Npas1P97459 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Npas1P97459 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Npas1P97459 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Npas1P97459 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Npas1P97459 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Npas1P97459 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Npas1P97459 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Npas1P97459 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Npas1P97459 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Npas1P97459 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Npas1P97459 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Npas1P97459 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Npas1P97459 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Npas1P97459 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Npas1P97459 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Npas1P97459 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Npas1P97459 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Npas1P97459 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Npas1P97459 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Npas1P97459 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Npas1P97459 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Npas1P97459 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Npas1P97459 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Npas1P97459 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Npas1P97459 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Npas1P97459 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Npas1P97459 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Npas1P97459 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Npas1P97459 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Npas1P97459 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Npas1P97459 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Npas1P97459 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Npas1P97459 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms