Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim43cP86449 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim43cP86449 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim43cP86449 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim43cP86449 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim43cP86449 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim43cP86449 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim43cP86449 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim43cP86449 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim43cP86449 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim43cP86449 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim43cP86449 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim43cP86449 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim43cP86449 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim43cP86449 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim43cP86449 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim43cP86449 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim43cP86449 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim43cP86449 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim43cP86449 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim43cP86449 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim43cP86449 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim43cP86449 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim43cP86449 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim43cP86449 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim43cP86449 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim43cP86449 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim43cP86449 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim43cP86449 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim43cP86449 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim43cP86449 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim43cP86449 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim43cP86449 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim43cP86449 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim43cP86449 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim43cP86449 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim43cP86449 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim43cP86449 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim43cP86449 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim43cP86449 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim43cP86449 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim43cP86449 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim43cP86449 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim43cP86449 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim43cP86449 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim43cP86449 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim43cP86449 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim43cP86449 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim43cP86449 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim43cP86449 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim43cP86449 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim43cP86449 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim43cP86449 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim43cP86449 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim43cP86449 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim43cP86449 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim43cP86449 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim43cP86449 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim43cP86449 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim43cP86449 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim43cP86449 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim43cP86449 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim43cP86449 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim43cP86449 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim43cP86449 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim43cP86449 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim43cP86449 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim43cP86449 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim43cP86449 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim43cP86449 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim43cP86449 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim43cP86449 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim43cP86449 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim43cP86449 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim43cP86449 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim43cP86449 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim43cP86449 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim43cP86449 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim43cP86449 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim43cP86449 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim43cP86449 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim43cP86449 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim43cP86449 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim43cP86449 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim43cP86449 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim43cP86449 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim43cP86449 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim43cP86449 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim43cP86449 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim43cP86449 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim43cP86449 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim43cP86449 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim43cP86449 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim43cP86449 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim43cP86449 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim43cP86449 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim43cP86449 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim43cP86449 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim43cP86449 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim43cP86449 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms