Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Polr1bP70700 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Polr1bP70700 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Polr1bP70700 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Polr1bP70700 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Polr1bP70700 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Polr1bP70700 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Polr1bP70700 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Polr1bP70700 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Polr1bP70700 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Polr1bP70700 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr1bP70700 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr1bP70700 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr1bP70700 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr1bP70700 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr1bP70700 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr1bP70700 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Polr1bP70700 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr1bP70700 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr1bP70700 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr1bP70700 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms