Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp3P63024 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp3P63024 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp3P63024 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vamp3P63024 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp3P63024 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp3P63024 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp3P63024 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp3P63024 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp3P63024 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp3P63024 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp3P63024 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp3P63024 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp3P63024 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp3P63024 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp3P63024 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp3P63024 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp3P63024 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp3P63024 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp3P63024 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp3P63024 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp3P63024 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp3P63024 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp3P63024 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms