Protein–RNA interactions for Protein: P62932

Fbxo40, F-box only protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo40P62932 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo40P62932 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo40P62932 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo40P62932 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo40P62932 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo40P62932 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo40P62932 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fbxo40P62932 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo40P62932 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo40P62932 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo40P62932 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo40P62932 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo40P62932 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo40P62932 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo40P62932 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo40P62932 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo40P62932 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo40P62932 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo40P62932 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo40P62932 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo40P62932 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo40P62932 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo40P62932 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo40P62932 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo40P62932 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo40P62932 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo40P62932 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo40P62932 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo40P62932 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo40P62932 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fbxo40P62932 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo40P62932 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo40P62932 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo40P62932 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo40P62932 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo40P62932 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo40P62932 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo40P62932 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo40P62932 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms