Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps3P62908 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps3P62908 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps3P62908 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps3P62908 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps3P62908 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps3P62908 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps3P62908 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps3P62908 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps3P62908 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps3P62908 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps3P62908 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps3P62908 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps3P62908 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps3P62908 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps3P62908 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps3P62908 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps3P62908 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps3P62908 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps3P62908 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps3P62908 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps3P62908 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps3P62908 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rps3P62908 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps3P62908 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps3P62908 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps3P62908 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps3P62908 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps3P62908 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps3P62908 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps3P62908 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps3P62908 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps3P62908 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps3P62908 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps3P62908 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps3P62908 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps3P62908 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps3P62908 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rps3P62908 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rps3P62908 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rps3P62908 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps3P62908 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps3P62908 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps3P62908 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps3P62908 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps3P62908 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps3P62908 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps3P62908 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps3P62908 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps3P62908 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps3P62908 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps3P62908 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps3P62908 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps3P62908 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps3P62908 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps3P62908 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps3P62908 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps3P62908 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps3P62908 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps3P62908 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps3P62908 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps3P62908 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps3P62908 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps3P62908 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps3P62908 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps3P62908 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps3P62908 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms