Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snap25P60879 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snap25P60879 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snap25P60879 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snap25P60879 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snap25P60879 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snap25P60879 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Snap25P60879 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap25P60879 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap25P60879 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Snap25P60879 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snap25P60879 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snap25P60879 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snap25P60879 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snap25P60879 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snap25P60879 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms