Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ephb3P54754 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ephb3P54754 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ephb3P54754 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ephb3P54754 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ephb3P54754 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ephb3P54754 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ephb3P54754 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ephb3P54754 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ephb3P54754 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ephb3P54754 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ephb3P54754 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ephb3P54754 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ephb3P54754 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ephb3P54754 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ephb3P54754 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ephb3P54754 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ephb3P54754 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ephb3P54754 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ephb3P54754 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ephb3P54754 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ephb3P54754 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ephb3P54754 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ephb3P54754 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ephb3P54754 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ephb3P54754 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ephb3P54754 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ephb3P54754 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ephb3P54754 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ephb3P54754 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ephb3P54754 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ephb3P54754 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ephb3P54754 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ephb3P54754 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ephb3P54754 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ephb3P54754 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ephb3P54754 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ephb3P54754 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ephb3P54754 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ephb3P54754 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ephb3P54754 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ephb3P54754 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ephb3P54754 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ephb3P54754 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ephb3P54754 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ephb3P54754 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ephb3P54754 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ephb3P54754 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ephb3P54754 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ephb3P54754 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ephb3P54754 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ephb3P54754 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ephb3P54754 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ephb3P54754 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ephb3P54754 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ephb3P54754 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ephb3P54754 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ephb3P54754 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ephb3P54754 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ephb3P54754 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ephb3P54754 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ephb3P54754 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ephb3P54754 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ephb3P54754 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ephb3P54754 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ephb3P54754 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ephb3P54754 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ephb3P54754 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ephb3P54754 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ephb3P54754 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ephb3P54754 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ephb3P54754 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ephb3P54754 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ephb3P54754 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ephb3P54754 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ephb3P54754 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ephb3P54754 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ephb3P54754 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ephb3P54754 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ephb3P54754 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ephb3P54754 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ephb3P54754 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ephb3P54754 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ephb3P54754 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ephb3P54754 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ephb3P54754 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ephb3P54754 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ephb3P54754 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ephb3P54754 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ephb3P54754 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ephb3P54754 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ephb3P54754 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ephb3P54754 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms