Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fgf9P54130 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgf9P54130 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgf9P54130 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fgf9P54130 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgf9P54130 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgf9P54130 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgf9P54130 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgf9P54130 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgf9P54130 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgf9P54130 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgf9P54130 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgf9P54130 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgf9P54130 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgf9P54130 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fgf9P54130 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgf9P54130 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgf9P54130 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms