Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RoraP51448 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RoraP51448 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RoraP51448 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RoraP51448 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RoraP51448 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RoraP51448 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RoraP51448 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RoraP51448 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RoraP51448 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RoraP51448 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RoraP51448 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RoraP51448 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RoraP51448 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RoraP51448 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RoraP51448 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RoraP51448 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RoraP51448 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RoraP51448 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RoraP51448 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RoraP51448 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RoraP51448 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RoraP51448 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RoraP51448 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RoraP51448 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RoraP51448 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RoraP51448 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RoraP51448 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RoraP51448 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RoraP51448 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RoraP51448 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RoraP51448 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RoraP51448 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RoraP51448 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RoraP51448 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RoraP51448 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RoraP51448 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RoraP51448 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RoraP51448 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RoraP51448 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RoraP51448 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RoraP51448 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RoraP51448 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RoraP51448 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RoraP51448 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RoraP51448 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RoraP51448 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RoraP51448 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RoraP51448 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RoraP51448 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RoraP51448 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RoraP51448 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RoraP51448 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RoraP51448 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RoraP51448 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RoraP51448 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RoraP51448 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RoraP51448 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RoraP51448 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RoraP51448 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RoraP51448 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RoraP51448 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RoraP51448 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RoraP51448 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RoraP51448 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RoraP51448 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RoraP51448 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RoraP51448 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RoraP51448 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RoraP51448 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RoraP51448 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RoraP51448 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RoraP51448 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RoraP51448 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RoraP51448 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RoraP51448 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RoraP51448 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RoraP51448 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RoraP51448 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RoraP51448 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RoraP51448 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RoraP51448 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RoraP51448 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RoraP51448 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RoraP51448 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RoraP51448 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RoraP51448 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RoraP51448 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RoraP51448 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RoraP51448 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RoraP51448 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RoraP51448 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RoraP51448 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RoraP51448 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RoraP51448 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RoraP51448 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RoraP51448 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RoraP51448 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RoraP51448 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RoraP51448 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms