Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CitP49025 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CitP49025 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CitP49025 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CitP49025 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CitP49025 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CitP49025 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CitP49025 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CitP49025 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CitP49025 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CitP49025 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CitP49025 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CitP49025 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CitP49025 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CitP49025 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CitP49025 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CitP49025 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CitP49025 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CitP49025 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CitP49025 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CitP49025 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CitP49025 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CitP49025 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CitP49025 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CitP49025 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CitP49025 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CitP49025 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CitP49025 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CitP49025 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CitP49025 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CitP49025 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CitP49025 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CitP49025 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CitP49025 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CitP49025 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CitP49025 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CitP49025 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CitP49025 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CitP49025 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CitP49025 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CitP49025 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CitP49025 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CitP49025 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CitP49025 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CitP49025 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CitP49025 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CitP49025 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CitP49025 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CitP49025 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CitP49025 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CitP49025 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CitP49025 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CitP49025 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CitP49025 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CitP49025 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CitP49025 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CitP49025 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CitP49025 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CitP49025 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CitP49025 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CitP49025 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CitP49025 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CitP49025 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CitP49025 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CitP49025 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CitP49025 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CitP49025 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CitP49025 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CitP49025 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CitP49025 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CitP49025 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CitP49025 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CitP49025 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CitP49025 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CitP49025 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CitP49025 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CitP49025 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CitP49025 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CitP49025 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CitP49025 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CitP49025 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CitP49025 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CitP49025 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CitP49025 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CitP49025 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CitP49025 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CitP49025 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CitP49025 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CitP49025 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CitP49025 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CitP49025 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CitP49025 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CitP49025 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CitP49025 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CitP49025 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CitP49025 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CitP49025 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CitP49025 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CitP49025 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CitP49025 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms