Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Notch4P31695 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Notch4P31695 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Notch4P31695 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Notch4P31695 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Notch4P31695 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Notch4P31695 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Notch4P31695 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Notch4P31695 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Notch4P31695 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Notch4P31695 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Notch4P31695 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Notch4P31695 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Notch4P31695 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Notch4P31695 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Notch4P31695 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Notch4P31695 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Notch4P31695 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Notch4P31695 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Notch4P31695 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Notch4P31695 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Notch4P31695 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Notch4P31695 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Notch4P31695 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Notch4P31695 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Notch4P31695 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Notch4P31695 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Notch4P31695 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Notch4P31695 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Notch4P31695 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Notch4P31695 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Notch4P31695 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Notch4P31695 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Notch4P31695 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Notch4P31695 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Notch4P31695 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Notch4P31695 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Notch4P31695 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Notch4P31695 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Notch4P31695 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Notch4P31695 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Notch4P31695 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Notch4P31695 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Notch4P31695 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Notch4P31695 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Notch4P31695 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Notch4P31695 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Notch4P31695 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Notch4P31695 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Notch4P31695 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Notch4P31695 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Notch4P31695 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Notch4P31695 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Notch4P31695 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Notch4P31695 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Notch4P31695 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Notch4P31695 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Notch4P31695 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Notch4P31695 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Notch4P31695 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Notch4P31695 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Notch4P31695 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Notch4P31695 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Notch4P31695 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Notch4P31695 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Notch4P31695 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Notch4P31695 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Notch4P31695 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Notch4P31695 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Notch4P31695 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Notch4P31695 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Notch4P31695 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Notch4P31695 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Notch4P31695 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Notch4P31695 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Notch4P31695 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Notch4P31695 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms