Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gjb1P28230 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gjb1P28230 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Gjb1P28230 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gjb1P28230 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gjb1P28230 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Gjb1P28230 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gjb1P28230 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gjb1P28230 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gjb1P28230 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gjb1P28230 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gjb1P28230 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gjb1P28230 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gjb1P28230 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gjb1P28230 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gjb1P28230 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gjb1P28230 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjb1P28230 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjb1P28230 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjb1P28230 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjb1P28230 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjb1P28230 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Gjb1P28230 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gjb1P28230 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gjb1P28230 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gjb1P28230 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gjb1P28230 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gjb1P28230 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gjb1P28230 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gjb1P28230 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gjb1P28230 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gjb1P28230 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Gjb1P28230 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gjb1P28230 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gjb1P28230 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gjb1P28230 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Gjb1P28230 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gjb1P28230 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gjb1P28230 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gjb1P28230 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gjb1P28230 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gjb1P28230 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjb1P28230 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gjb1P28230 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms