Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gria2P23819 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gria2P23819 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gria2P23819 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gria2P23819 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gria2P23819 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gria2P23819 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gria2P23819 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gria2P23819 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gria2P23819 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gria2P23819 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gria2P23819 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gria2P23819 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gria2P23819 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gria2P23819 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria2P23819 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gria2P23819 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gria2P23819 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gria2P23819 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gria2P23819 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gria2P23819 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gria2P23819 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gria2P23819 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gria2P23819 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gria2P23819 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gria2P23819 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gria2P23819 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gria2P23819 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gria2P23819 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gria2P23819 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gria2P23819 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gria2P23819 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gria2P23819 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gria2P23819 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gria2P23819 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gria2P23819 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gria2P23819 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gria2P23819 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gria2P23819 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gria2P23819 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gria2P23819 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gria2P23819 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gria2P23819 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gria2P23819 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms