Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irf8P23611 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irf8P23611 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irf8P23611 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irf8P23611 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irf8P23611 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irf8P23611 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Irf8P23611 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irf8P23611 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irf8P23611 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irf8P23611 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Irf8P23611 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf8P23611 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf8P23611 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf8P23611 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf8P23611 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf8P23611 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf8P23611 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf8P23611 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Irf8P23611 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irf8P23611 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irf8P23611 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irf8P23611 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irf8P23611 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irf8P23611 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irf8P23611 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irf8P23611 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irf8P23611 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irf8P23611 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Irf8P23611 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irf8P23611 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irf8P23611 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irf8P23611 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irf8P23611 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Irf8P23611 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Irf8P23611 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Irf8P23611 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Irf8P23611 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irf8P23611 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Irf8P23611 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irf8P23611 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irf8P23611 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irf8P23611 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irf8P23611 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irf8P23611 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irf8P23611 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irf8P23611 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irf8P23611 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irf8P23611 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irf8P23611 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irf8P23611 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Irf8P23611 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irf8P23611 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irf8P23611 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irf8P23611 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irf8P23611 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irf8P23611 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irf8P23611 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irf8P23611 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irf8P23611 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irf8P23611 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irf8P23611 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irf8P23611 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irf8P23611 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf8P23611 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf8P23611 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf8P23611 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf8P23611 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf8P23611 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irf8P23611 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irf8P23611 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irf8P23611 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irf8P23611 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irf8P23611 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Irf8P23611 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irf8P23611 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irf8P23611 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irf8P23611 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf8P23611 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf8P23611 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf8P23611 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf8P23611 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf8P23611 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf8P23611 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irf8P23611 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irf8P23611 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irf8P23611 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf8P23611 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf8P23611 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf8P23611 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf8P23611 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf8P23611 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irf8P23611 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irf8P23611 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irf8P23611 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irf8P23611 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irf8P23611 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Irf8P23611 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irf8P23611 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irf8P23611 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms