Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Clk1P22518 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clk1P22518 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clk1P22518 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clk1P22518 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clk1P22518 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Clk1P22518 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clk1P22518 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clk1P22518 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clk1P22518 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clk1P22518 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clk1P22518 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clk1P22518 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clk1P22518 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Clk1P22518 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clk1P22518 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clk1P22518 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clk1P22518 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Clk1P22518 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clk1P22518 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clk1P22518 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clk1P22518 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clk1P22518 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clk1P22518 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Clk1P22518 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clk1P22518 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clk1P22518 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clk1P22518 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clk1P22518 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Clk1P22518 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clk1P22518 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clk1P22518 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clk1P22518 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clk1P22518 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Clk1P22518 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clk1P22518 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clk1P22518 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clk1P22518 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clk1P22518 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clk1P22518 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clk1P22518 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clk1P22518 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clk1P22518 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clk1P22518 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clk1P22518 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clk1P22518 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clk1P22518 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clk1P22518 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clk1P22518 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clk1P22518 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clk1P22518 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clk1P22518 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clk1P22518 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clk1P22518 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Clk1P22518 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clk1P22518 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clk1P22518 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clk1P22518 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clk1P22518 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Clk1P22518 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Clk1P22518 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clk1P22518 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clk1P22518 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clk1P22518 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clk1P22518 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clk1P22518 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clk1P22518 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clk1P22518 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clk1P22518 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clk1P22518 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clk1P22518 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clk1P22518 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clk1P22518 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clk1P22518 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms