Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rb1P13405 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rb1P13405 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1P13405 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1P13405 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1P13405 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1P13405 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1P13405 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rb1P13405 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1P13405 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1P13405 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1P13405 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rb1P13405 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1P13405 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rb1P13405 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1P13405 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1P13405 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1P13405 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rb1P13405 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1P13405 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1P13405 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1P13405 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rb1P13405 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rb1P13405 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rb1P13405 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1P13405 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rb1P13405 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1P13405 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1P13405 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1P13405 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1P13405 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rb1P13405 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rb1P13405 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rb1P13405 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rb1P13405 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rb1P13405 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rb1P13405 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rb1P13405 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rb1P13405 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rb1P13405 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rb1P13405 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rb1P13405 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rb1P13405 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rb1P13405 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rb1P13405 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rb1P13405 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rb1P13405 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rb1P13405 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rb1P13405 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rb1P13405 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rb1P13405 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rb1P13405 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rb1P13405 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rb1P13405 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rb1P13405 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rb1P13405 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rb1P13405 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rb1P13405 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rb1P13405 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rb1P13405 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rb1P13405 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rb1P13405 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1P13405 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1P13405 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1P13405 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1P13405 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1P13405 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms