Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PolP11369 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PolP11369 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PolP11369 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PolP11369 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PolP11369 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PolP11369 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PolP11369 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PolP11369 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PolP11369 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PolP11369 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PolP11369 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PolP11369 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PolP11369 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PolP11369 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PolP11369 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PolP11369 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PolP11369 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PolP11369 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PolP11369 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PolP11369 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PolP11369 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PolP11369 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PolP11369 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PolP11369 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PolP11369 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PolP11369 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PolP11369 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PolP11369 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PolP11369 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PolP11369 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PolP11369 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PolP11369 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PolP11369 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PolP11369 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PolP11369 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PolP11369 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PolP11369 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PolP11369 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PolP11369 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PolP11369 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PolP11369 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PolP11369 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PolP11369 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PolP11369 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PolP11369 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PolP11369 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PolP11369 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PolP11369 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PolP11369 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PolP11369 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PolP11369 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PolP11369 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PolP11369 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PolP11369 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PolP11369 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PolP11369 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PolP11369 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PolP11369 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PolP11369 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PolP11369 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PolP11369 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PolP11369 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PolP11369 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PolP11369 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PolP11369 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PolP11369 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PolP11369 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PolP11369 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PolP11369 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PolP11369 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PolP11369 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PolP11369 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PolP11369 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PolP11369 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PolP11369 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PolP11369 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PolP11369 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PolP11369 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PolP11369 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PolP11369 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PolP11369 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PolP11369 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PolP11369 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PolP11369 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PolP11369 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PolP11369 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PolP11369 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PolP11369 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PolP11369 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PolP11369 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PolP11369 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PolP11369 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PolP11369 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PolP11369 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PolP11369 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PolP11369 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PolP11369 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PolP11369 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PolP11369 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms