Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P04212 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P04212 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P04212 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P04212 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P04212 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04212 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04212 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04212 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04212 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04212 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04212 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P04212 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P04212 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04212 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04212 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04212 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04212 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04212 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04212 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P04212 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04212 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04212 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04212 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04212 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P04212 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04212 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04212 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P04212 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04212 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04212 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04212 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04212 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04212 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P04212 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04212 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P04212 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04212 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04212 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P04212 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P04212 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04212 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04212 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04212 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04212 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P04212 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P04212 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P04212 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P04212 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P04212 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P04212 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P04212 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P04212 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P04212 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P04212 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P04212 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P04212 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P04212 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P04212 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P04212 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P04212 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P04212 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P04212 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P04212 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P04212 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P04212 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P04212 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P04212 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P04212 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P04212 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P04212 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P04212 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P04212 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P04212 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P04212 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P04212 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P04212 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P04212 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P04212 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P04212 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P04212 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P04212 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P04212 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P04212 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P04212 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P04212 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P04212 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P04212 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P04212 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P04212 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P04212 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P04212 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P04212 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P04212 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P04212 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P04212 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P04212 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P04212 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P04212 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
P04212 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms