Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hmx1O70218 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Hmx1O70218 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Hmx1O70218 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmx1O70218 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmx1O70218 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmx1O70218 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmx1O70218 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmx1O70218 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmx1O70218 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hmx1O70218 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hmx1O70218 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hmx1O70218 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hmx1O70218 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hmx1O70218 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hmx1O70218 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hmx1O70218 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hmx1O70218 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hmx1O70218 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hmx1O70218 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hmx1O70218 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hmx1O70218 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hmx1O70218 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hmx1O70218 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Hmx1O70218 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hmx1O70218 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hmx1O70218 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hmx1O70218 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hmx1O70218 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hmx1O70218 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hmx1O70218 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hmx1O70218 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hmx1O70218 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hmx1O70218 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hmx1O70218 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hmx1O70218 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hmx1O70218 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hmx1O70218 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hmx1O70218 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hmx1O70218 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hmx1O70218 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmx1O70218 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmx1O70218 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmx1O70218 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hmx1O70218 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hmx1O70218 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hmx1O70218 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hmx1O70218 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms