Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Copb2O55029 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Copb2O55029 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Copb2O55029 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Copb2O55029 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Copb2O55029 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Copb2O55029 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Copb2O55029 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Copb2O55029 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Copb2O55029 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Copb2O55029 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Copb2O55029 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Copb2O55029 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Copb2O55029 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Copb2O55029 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Copb2O55029 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Copb2O55029 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Copb2O55029 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Copb2O55029 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Copb2O55029 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Copb2O55029 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Copb2O55029 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Copb2O55029 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Copb2O55029 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Copb2O55029 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Copb2O55029 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Copb2O55029 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Copb2O55029 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Copb2O55029 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Copb2O55029 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Copb2O55029 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Copb2O55029 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Copb2O55029 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Copb2O55029 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Copb2O55029 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Copb2O55029 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Copb2O55029 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Copb2O55029 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Copb2O55029 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Copb2O55029 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Copb2O55029 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Copb2O55029 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Copb2O55029 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Copb2O55029 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Copb2O55029 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Copb2O55029 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Copb2O55029 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Copb2O55029 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Copb2O55029 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Copb2O55029 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Copb2O55029 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Copb2O55029 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Copb2O55029 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Copb2O55029 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Copb2O55029 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Copb2O55029 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Copb2O55029 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Copb2O55029 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Copb2O55029 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Copb2O55029 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Copb2O55029 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Copb2O55029 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Copb2O55029 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Copb2O55029 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Copb2O55029 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Copb2O55029 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Copb2O55029 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Copb2O55029 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Copb2O55029 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Copb2O55029 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Copb2O55029 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Copb2O55029 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Copb2O55029 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Copb2O55029 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Copb2O55029 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Copb2O55029 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Copb2O55029 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Copb2O55029 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Copb2O55029 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Copb2O55029 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Copb2O55029 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Copb2O55029 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Copb2O55029 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Copb2O55029 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Copb2O55029 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Copb2O55029 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Copb2O55029 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Copb2O55029 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Copb2O55029 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Copb2O55029 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Copb2O55029 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Copb2O55029 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms