Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl25O35903 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl25O35903 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl25O35903 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms