Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RaxO35602 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RaxO35602 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RaxO35602 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RaxO35602 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RaxO35602 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RaxO35602 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RaxO35602 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RaxO35602 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RaxO35602 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RaxO35602 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RaxO35602 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RaxO35602 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RaxO35602 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RaxO35602 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RaxO35602 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RaxO35602 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RaxO35602 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RaxO35602 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RaxO35602 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RaxO35602 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RaxO35602 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RaxO35602 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RaxO35602 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RaxO35602 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RaxO35602 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RaxO35602 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RaxO35602 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RaxO35602 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RaxO35602 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RaxO35602 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RaxO35602 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RaxO35602 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RaxO35602 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RaxO35602 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RaxO35602 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RaxO35602 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RaxO35602 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RaxO35602 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RaxO35602 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RaxO35602 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RaxO35602 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RaxO35602 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RaxO35602 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RaxO35602 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RaxO35602 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RaxO35602 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RaxO35602 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RaxO35602 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RaxO35602 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RaxO35602 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RaxO35602 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RaxO35602 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RaxO35602 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RaxO35602 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RaxO35602 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RaxO35602 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RaxO35602 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RaxO35602 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RaxO35602 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RaxO35602 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RaxO35602 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RaxO35602 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RaxO35602 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RaxO35602 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RaxO35602 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RaxO35602 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RaxO35602 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RaxO35602 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RaxO35602 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RaxO35602 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RaxO35602 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RaxO35602 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RaxO35602 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RaxO35602 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RaxO35602 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RaxO35602 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RaxO35602 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RaxO35602 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RaxO35602 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RaxO35602 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RaxO35602 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RaxO35602 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RaxO35602 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RaxO35602 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RaxO35602 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RaxO35602 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RaxO35602 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RaxO35602 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RaxO35602 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RaxO35602 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RaxO35602 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RaxO35602 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RaxO35602 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RaxO35602 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RaxO35602 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RaxO35602 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RaxO35602 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RaxO35602 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RaxO35602 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms