Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TnxbO35452 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TnxbO35452 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TnxbO35452 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnxbO35452 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnxbO35452 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnxbO35452 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnxbO35452 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnxbO35452 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TnxbO35452 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnxbO35452 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TnxbO35452 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnxbO35452 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnxbO35452 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TnxbO35452 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TnxbO35452 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TnxbO35452 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TnxbO35452 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TnxbO35452 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TnxbO35452 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TnxbO35452 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TnxbO35452 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TnxbO35452 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TnxbO35452 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnxbO35452 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnxbO35452 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnxbO35452 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnxbO35452 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnxbO35452 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnxbO35452 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnxbO35452 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnxbO35452 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnxbO35452 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnxbO35452 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TnxbO35452 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnxbO35452 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnxbO35452 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnxbO35452 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnxbO35452 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnxbO35452 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TnxbO35452 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TnxbO35452 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TnxbO35452 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TnxbO35452 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TnxbO35452 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TnxbO35452 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TnxbO35452 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TnxbO35452 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms