Protein–RNA interactions for Protein: O19442

H2-M9, Histocompatibility 2, M region locus 9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M9O19442 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-M9O19442 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2-M9O19442 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-M9O19442 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-M9O19442 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-M9O19442 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-M9O19442 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-M9O19442 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-M9O19442 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-M9O19442 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-M9O19442 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-M9O19442 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-M9O19442 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-M9O19442 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-M9O19442 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-M9O19442 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-M9O19442 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-M9O19442 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-M9O19442 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-M9O19442 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-M9O19442 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-M9O19442 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-M9O19442 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-M9O19442 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-M9O19442 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-M9O19442 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-M9O19442 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-M9O19442 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-M9O19442 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-M9O19442 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-M9O19442 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-M9O19442 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-M9O19442 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-M9O19442 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-M9O19442 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-M9O19442 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-M9O19442 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-M9O19442 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-M9O19442 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-M9O19442 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-M9O19442 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-M9O19442 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-M9O19442 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms