Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm2056J3QQ02 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm2056J3QQ02 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm2056J3QQ02 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm2056J3QQ02 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2056J3QQ02 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2056J3QQ02 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2056J3QQ02 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2056J3QQ02 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm2056J3QQ02 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm2056J3QQ02 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2056J3QQ02 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2056J3QQ02 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2056J3QQ02 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2056J3QQ02 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2056J3QQ02 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2056J3QQ02 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2056J3QQ02 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2056J3QQ02 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm2056J3QQ02 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm2056J3QQ02 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm2056J3QQ02 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2056J3QQ02 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2056J3QQ02 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2056J3QQ02 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2056J3QQ02 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm2056J3QQ02 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm2056J3QQ02 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm2056J3QQ02 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm2056J3QQ02 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm2056J3QQ02 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm2056J3QQ02 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm2056J3QQ02 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm2056J3QQ02 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm2056J3QQ02 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm2056J3QQ02 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm2056J3QQ02 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm2056J3QQ02 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm2056J3QQ02 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm2056J3QQ02 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm2056J3QQ02 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm2056J3QQ02 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm2056J3QQ02 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms