Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5160F8VPN3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5160F8VPN3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5160F8VPN3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5160F8VPN3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5160F8VPN3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5160F8VPN3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm5160F8VPN3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm5160F8VPN3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm5160F8VPN3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm5160F8VPN3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5160F8VPN3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5160F8VPN3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5160F8VPN3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5160F8VPN3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5160F8VPN3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5160F8VPN3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5160F8VPN3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5160F8VPN3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5160F8VPN3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5160F8VPN3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5160F8VPN3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5160F8VPN3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm5160F8VPN3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5160F8VPN3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5160F8VPN3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5160F8VPN3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5160F8VPN3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5160F8VPN3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5160F8VPN3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5160F8VPN3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5160F8VPN3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5160F8VPN3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5160F8VPN3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5160F8VPN3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5160F8VPN3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5160F8VPN3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5160F8VPN3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5160F8VPN3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5160F8VPN3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5160F8VPN3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5160F8VPN3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm5160F8VPN3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm5160F8VPN3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm5160F8VPN3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5160F8VPN3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5160F8VPN3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5160F8VPN3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5160F8VPN3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5160F8VPN3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5160F8VPN3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5160F8VPN3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5160F8VPN3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5160F8VPN3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5160F8VPN3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5160F8VPN3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5160F8VPN3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5160F8VPN3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5160F8VPN3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5160F8VPN3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms