Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UtrnE9Q6R7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UtrnE9Q6R7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UtrnE9Q6R7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UtrnE9Q6R7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
UtrnE9Q6R7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
UtrnE9Q6R7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UtrnE9Q6R7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
UtrnE9Q6R7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
UtrnE9Q6R7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UtrnE9Q6R7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UtrnE9Q6R7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UtrnE9Q6R7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UtrnE9Q6R7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UtrnE9Q6R7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UtrnE9Q6R7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UtrnE9Q6R7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UtrnE9Q6R7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UtrnE9Q6R7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UtrnE9Q6R7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UtrnE9Q6R7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
UtrnE9Q6R7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UtrnE9Q6R7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UtrnE9Q6R7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UtrnE9Q6R7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UtrnE9Q6R7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UtrnE9Q6R7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UtrnE9Q6R7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UtrnE9Q6R7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
UtrnE9Q6R7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UtrnE9Q6R7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UtrnE9Q6R7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UtrnE9Q6R7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UtrnE9Q6R7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UtrnE9Q6R7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UtrnE9Q6R7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UtrnE9Q6R7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UtrnE9Q6R7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
UtrnE9Q6R7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UtrnE9Q6R7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UtrnE9Q6R7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UtrnE9Q6R7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UtrnE9Q6R7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UtrnE9Q6R7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UtrnE9Q6R7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
UtrnE9Q6R7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UtrnE9Q6R7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UtrnE9Q6R7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UtrnE9Q6R7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UtrnE9Q6R7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UtrnE9Q6R7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
UtrnE9Q6R7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UtrnE9Q6R7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UtrnE9Q6R7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
UtrnE9Q6R7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UtrnE9Q6R7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UtrnE9Q6R7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UtrnE9Q6R7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UtrnE9Q6R7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UtrnE9Q6R7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UtrnE9Q6R7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UtrnE9Q6R7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UtrnE9Q6R7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
UtrnE9Q6R7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
UtrnE9Q6R7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
UtrnE9Q6R7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UtrnE9Q6R7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UtrnE9Q6R7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UtrnE9Q6R7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UtrnE9Q6R7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UtrnE9Q6R7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UtrnE9Q6R7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UtrnE9Q6R7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UtrnE9Q6R7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UtrnE9Q6R7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UtrnE9Q6R7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UtrnE9Q6R7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UtrnE9Q6R7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UtrnE9Q6R7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UtrnE9Q6R7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UtrnE9Q6R7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UtrnE9Q6R7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
UtrnE9Q6R7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
UtrnE9Q6R7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UtrnE9Q6R7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UtrnE9Q6R7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UtrnE9Q6R7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
UtrnE9Q6R7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UtrnE9Q6R7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UtrnE9Q6R7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UtrnE9Q6R7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
UtrnE9Q6R7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UtrnE9Q6R7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UtrnE9Q6R7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UtrnE9Q6R7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UtrnE9Q6R7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UtrnE9Q6R7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UtrnE9Q6R7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
UtrnE9Q6R7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
UtrnE9Q6R7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 292.5 ms