Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
9230113P08RikD3YWX3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
9230113P08RikD3YWX3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
9230113P08RikD3YWX3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
9230113P08RikD3YWX3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
9230113P08RikD3YWX3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
9230113P08RikD3YWX3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
9230113P08RikD3YWX3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
9230113P08RikD3YWX3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
9230113P08RikD3YWX3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
9230113P08RikD3YWX3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
9230113P08RikD3YWX3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
9230113P08RikD3YWX3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
9230113P08RikD3YWX3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
9230113P08RikD3YWX3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
9230113P08RikD3YWX3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
9230113P08RikD3YWX3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
9230113P08RikD3YWX3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
9230113P08RikD3YWX3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
9230113P08RikD3YWX3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
9230113P08RikD3YWX3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
9230113P08RikD3YWX3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
9230113P08RikD3YWX3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
9230113P08RikD3YWX3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
9230113P08RikD3YWX3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms