Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rexo5D3YW29 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rexo5D3YW29 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rexo5D3YW29 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rexo5D3YW29 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rexo5D3YW29 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rexo5D3YW29 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rexo5D3YW29 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rexo5D3YW29 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Rexo5D3YW29 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rexo5D3YW29 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rexo5D3YW29 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rexo5D3YW29 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rexo5D3YW29 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rexo5D3YW29 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rexo5D3YW29 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rexo5D3YW29 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rexo5D3YW29 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rexo5D3YW29 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rexo5D3YW29 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rexo5D3YW29 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rexo5D3YW29 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rexo5D3YW29 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rexo5D3YW29 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rexo5D3YW29 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rexo5D3YW29 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rexo5D3YW29 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rexo5D3YW29 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Rexo5D3YW29 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Rexo5D3YW29 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rexo5D3YW29 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rexo5D3YW29 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rexo5D3YW29 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rexo5D3YW29 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rexo5D3YW29 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rexo5D3YW29 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rexo5D3YW29 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Rexo5D3YW29 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Rexo5D3YW29 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rexo5D3YW29 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rexo5D3YW29 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rexo5D3YW29 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rexo5D3YW29 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rexo5D3YW29 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rexo5D3YW29 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rexo5D3YW29 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rexo5D3YW29 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rexo5D3YW29 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rexo5D3YW29 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rexo5D3YW29 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rexo5D3YW29 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rexo5D3YW29 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rexo5D3YW29 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rexo5D3YW29 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rexo5D3YW29 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rexo5D3YW29 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rexo5D3YW29 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rexo5D3YW29 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rexo5D3YW29 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rexo5D3YW29 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rexo5D3YW29 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms