Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2d4D3YUH6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2d4D3YUH6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2d4D3YUH6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2d4D3YUH6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2d4D3YUH6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2d4D3YUH6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2d4D3YUH6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d4D3YUH6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d4D3YUH6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d4D3YUH6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d4D3YUH6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d4D3YUH6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d4D3YUH6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d4D3YUH6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2d4D3YUH6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2d4D3YUH6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2d4D3YUH6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ube2d4D3YUH6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ube2d4D3YUH6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2d4D3YUH6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2d4D3YUH6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2d4D3YUH6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2d4D3YUH6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2d4D3YUH6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2d4D3YUH6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2d4D3YUH6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2d4D3YUH6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2d4D3YUH6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2d4D3YUH6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2d4D3YUH6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ube2d4D3YUH6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms