Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Phf11cB4XVP9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phf11cB4XVP9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf11cB4XVP9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf11cB4XVP9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms