Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scml2B1AVB3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scml2B1AVB3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scml2B1AVB3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scml2B1AVB3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms