Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grik3B1AS29 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grik3B1AS29 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grik3B1AS29 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grik3B1AS29 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grik3B1AS29 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grik3B1AS29 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grik3B1AS29 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grik3B1AS29 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grik3B1AS29 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grik3B1AS29 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grik3B1AS29 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grik3B1AS29 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grik3B1AS29 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grik3B1AS29 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grik3B1AS29 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Grik3B1AS29 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Grik3B1AS29 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Grik3B1AS29 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grik3B1AS29 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grik3B1AS29 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grik3B1AS29 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grik3B1AS29 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grik3B1AS29 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grik3B1AS29 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grik3B1AS29 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grik3B1AS29 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Grik3B1AS29 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grik3B1AS29 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grik3B1AS29 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grik3B1AS29 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grik3B1AS29 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grik3B1AS29 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grik3B1AS29 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grik3B1AS29 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grik3B1AS29 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grik3B1AS29 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grik3B1AS29 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grik3B1AS29 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grik3B1AS29 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms