Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AgrnA2ASQ1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AgrnA2ASQ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AgrnA2ASQ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AgrnA2ASQ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AgrnA2ASQ1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AgrnA2ASQ1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AgrnA2ASQ1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AgrnA2ASQ1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AgrnA2ASQ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AgrnA2ASQ1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AgrnA2ASQ1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AgrnA2ASQ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AgrnA2ASQ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AgrnA2ASQ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AgrnA2ASQ1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AgrnA2ASQ1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AgrnA2ASQ1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AgrnA2ASQ1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AgrnA2ASQ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AgrnA2ASQ1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AgrnA2ASQ1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
AgrnA2ASQ1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
AgrnA2ASQ1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AgrnA2ASQ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AgrnA2ASQ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AgrnA2ASQ1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AgrnA2ASQ1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AgrnA2ASQ1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AgrnA2ASQ1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AgrnA2ASQ1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AgrnA2ASQ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AgrnA2ASQ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms