Protein–RNA interactions for Protein: A2AJA7

Mamdc4, Apical endosomal glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 1,228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mamdc4A2AJA7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mamdc4A2AJA7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Mamdc4A2AJA7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mamdc4A2AJA7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mamdc4A2AJA7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mamdc4A2AJA7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mamdc4A2AJA7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mamdc4A2AJA7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mamdc4A2AJA7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mamdc4A2AJA7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mamdc4A2AJA7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mamdc4A2AJA7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mamdc4A2AJA7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mamdc4A2AJA7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mamdc4A2AJA7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mamdc4A2AJA7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mamdc4A2AJA7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mamdc4A2AJA7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mamdc4A2AJA7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mamdc4A2AJA7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mamdc4A2AJA7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mamdc4A2AJA7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms