Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Calcoco2A2A6M5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Calcoco2A2A6M5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calcoco2A2A6M5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calcoco2A2A6M5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calcoco2A2A6M5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calcoco2A2A6M5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calcoco2A2A6M5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Calcoco2A2A6M5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calcoco2A2A6M5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calcoco2A2A6M5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calcoco2A2A6M5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Calcoco2A2A6M5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calcoco2A2A6M5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calcoco2A2A6M5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calcoco2A2A6M5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calcoco2A2A6M5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calcoco2A2A6M5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms