RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 OR2T34Q8NGX1 318 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 IL31RAQ8NI17 732 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 LHFPL5Q8TAF8 219 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC20Q8TCA0 184 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 HTR3CQ8WXA8 447 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RLN3Q8WXF3 142 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PROX1Q92786 737 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CORO2AQ92828 525 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SPSB4Q96A44 273 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PHF21AQ96BD5 680 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF479Q96JC4 524 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 C12orf66Q96MD2 445 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 GCNAQ96QF7 691 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 HAPLN3Q96S86 360 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 INTS14Q96SY0 518 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SSX3Q99909 188 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 C11orf70Q9BRQ4 267 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CENPKQ9BS16 269 aa3□□□□□ -1.93
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PTPRM-204ENST00000577468 TUBB2BQ9BVA1 445 aa3□□□□□ -1.93
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PTPRM-204ENST00000577468 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PKIBQ9C010 78 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TWSG1Q9GZX9 223 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MFFQ9GZY8 342 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 OR51B6Q9H340 312 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 DPEP3Q9H4B8 488 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ASB8Q9H765 288 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PNPLA3Q9NST1 481 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 LMBRD1Q9NUN5 540 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 UFSP2Q9NUQ7 469 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TDP1Q9NUW8 608 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CNIH4Q9P003 139 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ERVK-18Q9QC07 812 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 DKK2Q9UBU2 259 aa3□□□□□ -1.93
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PTPRM-204ENST00000577468 POLLQ9UGP5 575 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
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PTPRM-204ENST00000577468 IL20RAQ9UHF4 553 aa3□□□□□ -1.93
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PTPRM-204ENST00000577468 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 KCNK7Q9Y2U2 307 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
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PTPRM-204ENST00000577468 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0J9YYE9 177 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 FAM234BA2RU67 622 aa2.99□□□□□ -1.93
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PTPRM-204ENST00000577468 A8MXQ7 604 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 E5RI56 91 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NPIPA2E9PIF3 369 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 F8WDY8 70 aa2.99□□□□□ -1.93
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PTPRM-204ENST00000577468 NR5A2O00482 541 aa2.99□□□□□ -1.93
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PTPRM-204ENST00000577468 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.934e-6■□□□□ 9.7
PTPRM-204ENST00000577468 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CLOCKO15516 846 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SEC14L5O43304 696 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 COCHO43405 550 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PFKFB2O60825 505 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 WBP4O75554 376 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SCGB2A1O75556 95 aa2.99□□□□□ -1.93
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