RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	CBSL	P0DN79	551 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	SAT1	P21673	171 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	MCM3	P25205	808 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	CBS	P35520	551 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	UCN	P55089	124 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	KYNU	Q16719	465 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	SPESP1	Q6UW49	350 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	GALNT7	Q86SF2	657 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	BMPER	Q8N8U9	685 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	CD200R1	Q8TD46	325 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	IL17F	Q96PD4	163 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	APMAP	Q9HDC9	416 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	GALP	Q9UBC7	116 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	RARRES3	Q9UL19	164 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	DHRS7	Q9Y394	339 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CHID1-222	ENST00000533059		A0A0J9YY10	115 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF839	A8K0R7	811 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	GSTA2	P09210	222 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	MPC1L	P0DKB6	136 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	UGT2B7	P16662	529 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	CD9	P21926	228 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	SSTR1	P30872	391 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	STX2	P32856	288 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	SLC12A2	P55011	1212 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	GBX1	Q14549	363 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	IL11RA	Q14626	422 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	KCNAB1	Q14722	419 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	KIR2DS3	Q14952	304 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	MANEA	Q5SRI9	462 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	IFT81	Q8WYA0	676 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	PMEPA1	Q969W9	287 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	SLC30A3	Q99726	388 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	NRTN	Q99748	197 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	ZBTB14	O43829	449 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	RAD1	O60671	282 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	SPAG6	O75602	509 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	STK17B	O94768	372 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	ST6GAL1	P15907	406 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	CYP2A7	P20853	494 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	ITPKB	P27987	946 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	MAGEA4	P43358	317 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	TMPRSS3	P57727	454 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	CLN3	Q13286	438 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	TRIM73	Q86UV7	250 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	LINGO1	Q96FE5	620 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	PPM1M	Q96MI6	270 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	FGF21	Q9NSA1	209 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		13.38	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27

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