RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 UBASH3BQ8TF42 649 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 RGMAQ96B86 450 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC3Q9BY71 257 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 ABI3Q9P2A4 366 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB26Q9ULW5 256 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 PGRMC2O15173 223 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 CHST10O43529 356 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 MMP20O60882 483 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 WBP4O75554 376 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 GIMD1P0DJR0 217 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 PRKCHP24723 683 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 C17orf99Q6UX52 265 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 CAMKVQ8NCB2 501 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 HM13Q8TCT9 377 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 GIPC3Q8TF64 312 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 EBF3Q9H4W6 596 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 RASSF1Q9NS23 344 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 BACE2Q9Y5Z0 518 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 SESN1Q9Y6P5 492 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 KMOO15229 486 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 IL7RP16871 459 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 PTPN5P54829 565 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 EIPR1Q53HC9 387 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 NAPRTQ6XQN6 538 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM46DQ8NEK8 389 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 CMTM7Q96FZ5 175 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 DERL2Q9GZP9 239 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 B4GALT6Q9UBX8 382 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 MYH2Q9UKX2 1941 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 TMCC2O75069 709 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 SERPINA1P01009 418 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 IL12BP29460 328 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 GSTT1P30711 240 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 PIK3CBP42338 1070 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 INAVAQ3KP66 663 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 KRT74Q7RTS7 529 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 CILP2Q8IUL8 1156 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 ZZZ3Q8IYH5 903 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 CBR4Q8N4T8 237 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 RGS10O43665 173 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 CCNB2O95067 398 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 CCR10P46092 362 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 GPX6P59796 221 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 ABHD13Q7L211 337 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 CLDN19Q8N6F1 224 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 SIGLEC10Q96LC7 697 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 PSKH2Q96QS6 385 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 HAT1O14929 419 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 DLX3O60479 287 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 OR5F1O95221 314 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 CFIP05156 583 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 RHOP08100 348 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 CDH12P55289 794 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 C14orf80Q86SX3 495 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 OR52J3Q8NH60 311 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 S100ZQ8WXG8 99 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNJ9Q92806 393 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 ADAP2Q9NPF8 381 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 IKZF2Q9UKS7 526 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX7Q9UNH6 387 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 NME6O75414 186 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 OAS1P00973 400 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 HMGCS1Q01581 520 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 PRSS58Q8IYP2 241 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 LRIG1Q96JA1 1093 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 EBF4Q9BQW3 602 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 HCN3Q9P1Z3 774 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 STON1Q9Y6Q2 735 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 KLF11O14901 512 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 AP2A2O94973 939 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 ADH1BP00325 375 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 ITGADQ13349 1161 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF311Q5JNZ3 666 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 GPRC6AQ5T6X5 926 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 TIFABQ6ZNK6 161 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 PEX13Q92968 403 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF347Q96SE7 839 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 IL23AQ9NPF7 189 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 GALNT8Q9NY28 637 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 GALPQ9UBC7 116 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 SATB2Q9UPW6 733 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC22A14Q9Y267 594 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 MT-ND1P03886 318 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 CYBAP13498 195 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 SP140Q13342 867 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 SEMA3AQ14563 771 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM145Q8NBT3 493 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms